Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pom121Q8K3Z9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pom121Q8K3Z9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pom121Q8K3Z9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pom121Q8K3Z9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pom121Q8K3Z9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pom121Q8K3Z9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pom121Q8K3Z9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pom121Q8K3Z9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms