Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sidt2Q8CIF6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sidt2Q8CIF6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sidt2Q8CIF6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sidt2Q8CIF6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sidt2Q8CIF6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sidt2Q8CIF6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sidt2Q8CIF6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sidt2Q8CIF6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sidt2Q8CIF6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sidt2Q8CIF6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sidt2Q8CIF6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sidt2Q8CIF6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sidt2Q8CIF6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms