Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc8Q8CFD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc8Q8CFD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc8Q8CFD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ercc8Q8CFD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ercc8Q8CFD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ercc8Q8CFD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ercc8Q8CFD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc8Q8CFD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ercc8Q8CFD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ercc8Q8CFD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ercc8Q8CFD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ercc8Q8CFD5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms