Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ClasrpQ8CFC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ClasrpQ8CFC7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ClasrpQ8CFC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ClasrpQ8CFC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ClasrpQ8CFC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ClasrpQ8CFC7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ClasrpQ8CFC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ClasrpQ8CFC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
ClasrpQ8CFC7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ClasrpQ8CFC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ClasrpQ8CFC7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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