Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snx17Q8BVL3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Snx17Q8BVL3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snx17Q8BVL3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snx17Q8BVL3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snx17Q8BVL3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snx17Q8BVL3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx17Q8BVL3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx17Q8BVL3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx17Q8BVL3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snx17Q8BVL3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx17Q8BVL3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snx17Q8BVL3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snx17Q8BVL3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snx17Q8BVL3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx17Q8BVL3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx17Q8BVL3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx17Q8BVL3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snx17Q8BVL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx17Q8BVL3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx17Q8BVL3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx17Q8BVL3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx17Q8BVL3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx17Q8BVL3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snx17Q8BVL3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Snx17Q8BVL3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx17Q8BVL3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx17Q8BVL3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snx17Q8BVL3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx17Q8BVL3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Snx17Q8BVL3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx17Q8BVL3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx17Q8BVL3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx17Q8BVL3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx17Q8BVL3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snx17Q8BVL3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snx17Q8BVL3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms