Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl42Q8BFQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl42Q8BFQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl42Q8BFQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Klhl42Q8BFQ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl42Q8BFQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl42Q8BFQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl42Q8BFQ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl42Q8BFQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl42Q8BFQ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms