Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp8Q80U87 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp8Q80U87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp8Q80U87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp8Q80U87 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp8Q80U87 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp8Q80U87 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp8Q80U87 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp8Q80U87 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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