Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CenpeQ6RT24 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpeQ6RT24 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpeQ6RT24 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CenpeQ6RT24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpeQ6RT24 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CenpeQ6RT24 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpeQ6RT24 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpeQ6RT24 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpeQ6RT24 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpeQ6RT24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpeQ6RT24 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpeQ6RT24 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpeQ6RT24 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpeQ6RT24 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpeQ6RT24 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpeQ6RT24 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpeQ6RT24 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpeQ6RT24 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpeQ6RT24 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpeQ6RT24 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpeQ6RT24 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpeQ6RT24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpeQ6RT24 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms