Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gpbp1l1Q6NZP2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gpbp1l1Q6NZP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpbp1l1Q6NZP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gpbp1l1Q6NZP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms