Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jmjd1cQ69ZK6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Jmjd1cQ69ZK6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Jmjd1cQ69ZK6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd1cQ69ZK6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Jmjd1cQ69ZK6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd1cQ69ZK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd1cQ69ZK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd1cQ69ZK6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd1cQ69ZK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Jmjd1cQ69ZK6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Jmjd1cQ69ZK6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Jmjd1cQ69ZK6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Jmjd1cQ69ZK6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Jmjd1cQ69ZK6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Jmjd1cQ69ZK6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Jmjd1cQ69ZK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms