Protein–RNA interactions for Protein: Q64356

Svs6, Seminal vesicle secretory protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs6Q64356 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Svs6Q64356 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Svs6Q64356 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Svs6Q64356 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Svs6Q64356 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Svs6Q64356 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Svs6Q64356 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Svs6Q64356 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Svs6Q64356 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms