Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab34Q64008 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rab34Q64008 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rab34Q64008 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab34Q64008 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rab34Q64008 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rab34Q64008 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rab34Q64008 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rab34Q64008 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rab34Q64008 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rab34Q64008 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rab34Q64008 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab34Q64008 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab34Q64008 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab34Q64008 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab34Q64008 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab34Q64008 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab34Q64008 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab34Q64008 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms