Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn4Q62472 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lcn4Q62472 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lcn4Q62472 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lcn4Q62472 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lcn4Q62472 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lcn4Q62472 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn4Q62472 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn4Q62472 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms