Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttf1Q62187 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttf1Q62187 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttf1Q62187 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttf1Q62187 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttf1Q62187 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttf1Q62187 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttf1Q62187 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttf1Q62187 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttf1Q62187 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms