Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Gli3Q61602 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gli3Q61602 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Gli3Q61602 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Gli3Q61602 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gli3Q61602 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Gli3Q61602 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Gli3Q61602 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Gli3Q61602 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gli3Q61602 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Gli3Q61602 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Gli3Q61602 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gli3Q61602 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gli3Q61602 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Gli3Q61602 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Gli3Q61602 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Gli3Q61602 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Gli3Q61602 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gli3Q61602 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gli3Q61602 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gli3Q61602 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gli3Q61602 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gli3Q61602 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Gli3Q61602 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gli3Q61602 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Gli3Q61602 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gli3Q61602 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Gli3Q61602 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Gli3Q61602 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Gli3Q61602 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Gli3Q61602 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gli3Q61602 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gli3Q61602 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Gli3Q61602 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Gli3Q61602 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Gli3Q61602 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gli3Q61602 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gli3Q61602 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Gli3Q61602 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gli3Q61602 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gli3Q61602 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gli3Q61602 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gli3Q61602 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Gli3Q61602 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gli3Q61602 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Gli3Q61602 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Gli3Q61602 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Gli3Q61602 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Gli3Q61602 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Gli3Q61602 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Gli3Q61602 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Gli3Q61602 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Gli3Q61602 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gli3Q61602 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms