Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hcfc1Q61191 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hcfc1Q61191 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hcfc1Q61191 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcfc1Q61191 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcfc1Q61191 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcfc1Q61191 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcfc1Q61191 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcfc1Q61191 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcfc1Q61191 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcfc1Q61191 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcfc1Q61191 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hcfc1Q61191 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcfc1Q61191 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcfc1Q61191 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcfc1Q61191 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms