Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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