Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim38Q5SZ99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim38Q5SZ99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim38Q5SZ99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim38Q5SZ99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim38Q5SZ99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim38Q5SZ99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim38Q5SZ99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim38Q5SZ99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim38Q5SZ99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim38Q5SZ99 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms