Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ecm2Q5FW85 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ecm2Q5FW85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ecm2Q5FW85 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ecm2Q5FW85 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ecm2Q5FW85 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ecm2Q5FW85 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ecm2Q5FW85 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ecm2Q5FW85 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ecm2Q5FW85 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ecm2Q5FW85 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ecm2Q5FW85 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ecm2Q5FW85 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Ecm2Q5FW85 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ecm2Q5FW85 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ecm2Q5FW85 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ecm2Q5FW85 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ecm2Q5FW85 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ecm2Q5FW85 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ecm2Q5FW85 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ecm2Q5FW85 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ecm2Q5FW85 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ecm2Q5FW85 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ecm2Q5FW85 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ecm2Q5FW85 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Ecm2Q5FW85 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ecm2Q5FW85 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ecm2Q5FW85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ecm2Q5FW85 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ecm2Q5FW85 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ecm2Q5FW85 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ecm2Q5FW85 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ecm2Q5FW85 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ecm2Q5FW85 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ecm2Q5FW85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ecm2Q5FW85 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ecm2Q5FW85 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ecm2Q5FW85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ecm2Q5FW85 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ecm2Q5FW85 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ecm2Q5FW85 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ecm2Q5FW85 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms