Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ecm2Q5FW85 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ecm2Q5FW85 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Ecm2Q5FW85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ecm2Q5FW85 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Ecm2Q5FW85 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ecm2Q5FW85 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ecm2Q5FW85 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ecm2Q5FW85 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Ecm2Q5FW85 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ecm2Q5FW85 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Ecm2Q5FW85 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ecm2Q5FW85 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Ecm2Q5FW85 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ecm2Q5FW85 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ecm2Q5FW85 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ecm2Q5FW85 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ecm2Q5FW85 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ecm2Q5FW85 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ecm2Q5FW85 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ecm2Q5FW85 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ecm2Q5FW85 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ecm2Q5FW85 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Ecm2Q5FW85 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ecm2Q5FW85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ecm2Q5FW85 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Ecm2Q5FW85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ecm2Q5FW85 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ecm2Q5FW85 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ecm2Q5FW85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ecm2Q5FW85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ecm2Q5FW85 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ecm2Q5FW85 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ecm2Q5FW85 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ecm2Q5FW85 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ecm2Q5FW85 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ecm2Q5FW85 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ecm2Q5FW85 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ecm2Q5FW85 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ecm2Q5FW85 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ecm2Q5FW85 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ecm2Q5FW85 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ecm2Q5FW85 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ecm2Q5FW85 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ecm2Q5FW85 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ecm2Q5FW85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ecm2Q5FW85 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ecm2Q5FW85 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Ecm2Q5FW85 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ecm2Q5FW85 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ecm2Q5FW85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ecm2Q5FW85 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Ecm2Q5FW85 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ecm2Q5FW85 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ecm2Q5FW85 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ecm2Q5FW85 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ecm2Q5FW85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ecm2Q5FW85 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ecm2Q5FW85 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ecm2Q5FW85 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ecm2Q5FW85 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ecm2Q5FW85 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Ecm2Q5FW85 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Ecm2Q5FW85 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ecm2Q5FW85 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ecm2Q5FW85 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ecm2Q5FW85 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ecm2Q5FW85 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Ecm2Q5FW85 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ecm2Q5FW85 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ecm2Q5FW85 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Ecm2Q5FW85 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ecm2Q5FW85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ecm2Q5FW85 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ecm2Q5FW85 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ecm2Q5FW85 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ecm2Q5FW85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ecm2Q5FW85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ecm2Q5FW85 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Ecm2Q5FW85 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ecm2Q5FW85 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ecm2Q5FW85 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ecm2Q5FW85 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Ecm2Q5FW85 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ecm2Q5FW85 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ecm2Q5FW85 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ecm2Q5FW85 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ecm2Q5FW85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ecm2Q5FW85 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ecm2Q5FW85 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ecm2Q5FW85 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ecm2Q5FW85 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ecm2Q5FW85 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ecm2Q5FW85 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms