Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
Pds5bQ4VA53 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
Pds5bQ4VA53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Pds5bQ4VA53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
Pds5bQ4VA53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
Pds5bQ4VA53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
Pds5bQ4VA53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
Pds5bQ4VA53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.13
Pds5bQ4VA53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Pds5bQ4VA53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Pds5bQ4VA53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
Pds5bQ4VA53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
Pds5bQ4VA53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.07■■■■■ 5.13
Pds5bQ4VA53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Pds5bQ4VA53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Pds5bQ4VA53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
Pds5bQ4VA53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Pds5bQ4VA53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Pds5bQ4VA53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC46.99■■■■■ 5.11
Pds5bQ4VA53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.98■■■■■ 5.11
Pds5bQ4VA53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Pds5bQ4VA53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
Pds5bQ4VA53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
Pds5bQ4VA53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Pds5bQ4VA53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Pds5bQ4VA53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Pds5bQ4VA53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Pds5bQ4VA53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Pds5bQ4VA53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
Pds5bQ4VA53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
Pds5bQ4VA53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
Pds5bQ4VA53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
Pds5bQ4VA53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Pds5bQ4VA53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Pds5bQ4VA53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
Pds5bQ4VA53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Pds5bQ4VA53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Pds5bQ4VA53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
Pds5bQ4VA53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
Pds5bQ4VA53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Pds5bQ4VA53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Pds5bQ4VA53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Pds5bQ4VA53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Pds5bQ4VA53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
Pds5bQ4VA53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Pds5bQ4VA53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Pds5bQ4VA53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Pds5bQ4VA53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Pds5bQ4VA53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
Pds5bQ4VA53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Pds5bQ4VA53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
Pds5bQ4VA53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
Pds5bQ4VA53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Pds5bQ4VA53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC46.43■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
Pds5bQ4VA53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
Pds5bQ4VA53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC46.27■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC46.26■■■■■ 5
Pds5bQ4VA53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC46.25■■■■■ 4.99
Pds5bQ4VA53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
Pds5bQ4VA53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Pds5bQ4VA53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Pds5bQ4VA53 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC46.19■■■■■ 4.99
Pds5bQ4VA53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Pds5bQ4VA53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
Pds5bQ4VA53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Pds5bQ4VA53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Pds5bQ4VA53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
Pds5bQ4VA53 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Pds5bQ4VA53 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Pds5bQ4VA53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Pds5bQ4VA53 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
Pds5bQ4VA53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Pds5bQ4VA53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Pds5bQ4VA53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms