Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skap1Q3UUV5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skap1Q3UUV5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skap1Q3UUV5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skap1Q3UUV5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Skap1Q3UUV5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skap1Q3UUV5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skap1Q3UUV5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skap1Q3UUV5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skap1Q3UUV5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Skap1Q3UUV5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Skap1Q3UUV5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Skap1Q3UUV5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skap1Q3UUV5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Skap1Q3UUV5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skap1Q3UUV5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skap1Q3UUV5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skap1Q3UUV5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Skap1Q3UUV5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Skap1Q3UUV5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Skap1Q3UUV5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Skap1Q3UUV5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Skap1Q3UUV5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Skap1Q3UUV5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Skap1Q3UUV5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms