Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap9Q1HDU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap9Q1HDU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap9Q1HDU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap9Q1HDU4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap9Q1HDU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap9Q1HDU4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap9Q1HDU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap9Q1HDU4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap9Q1HDU4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap9Q1HDU4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap9Q1HDU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgap9Q1HDU4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms