Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Yy1Q00899 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Yy1Q00899 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Yy1Q00899 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Yy1Q00899 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Yy1Q00899 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Yy1Q00899 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Yy1Q00899 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Yy1Q00899 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Yy1Q00899 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Yy1Q00899 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Yy1Q00899 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Yy1Q00899 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Yy1Q00899 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Yy1Q00899 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Yy1Q00899 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Yy1Q00899 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Yy1Q00899 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Yy1Q00899 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Yy1Q00899 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Yy1Q00899 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Yy1Q00899 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Yy1Q00899 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Yy1Q00899 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Yy1Q00899 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Yy1Q00899 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Yy1Q00899 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Yy1Q00899 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Yy1Q00899 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Yy1Q00899 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Yy1Q00899 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Yy1Q00899 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms