Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smad1P70340 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smad1P70340 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smad1P70340 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Smad1P70340 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smad1P70340 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smad1P70340 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smad1P70340 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smad1P70340 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smad1P70340 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smad1P70340 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smad1P70340 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smad1P70340 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smad1P70340 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad1P70340 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad1P70340 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad1P70340 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad1P70340 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smad1P70340 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smad1P70340 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad1P70340 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smad1P70340 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smad1P70340 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad1P70340 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad1P70340 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad1P70340 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad1P70340 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad1P70340 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad1P70340 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad1P70340 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad1P70340 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smad1P70340 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms