Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CgnP59242 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CgnP59242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CgnP59242 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CgnP59242 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CgnP59242 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CgnP59242 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CgnP59242 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CgnP59242 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CgnP59242 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CgnP59242 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CgnP59242 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CgnP59242 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CgnP59242 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CgnP59242 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CgnP59242 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CgnP59242 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CgnP59242 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CgnP59242 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CgnP59242 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CgnP59242 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CgnP59242 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CgnP59242 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CgnP59242 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CgnP59242 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CgnP59242 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CgnP59242 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CgnP59242 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CgnP59242 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CgnP59242 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CgnP59242 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CgnP59242 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CgnP59242 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CgnP59242 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CgnP59242 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CgnP59242 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CgnP59242 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CgnP59242 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CgnP59242 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CgnP59242 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CgnP59242 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CgnP59242 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CgnP59242 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CgnP59242 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CgnP59242 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CgnP59242 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CgnP59242 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CgnP59242 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CgnP59242 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CgnP59242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CgnP59242 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CgnP59242 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CgnP59242 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CgnP59242 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CgnP59242 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CgnP59242 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CgnP59242 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CgnP59242 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CgnP59242 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CgnP59242 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CgnP59242 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CgnP59242 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CgnP59242 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CgnP59242 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CgnP59242 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CgnP59242 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CgnP59242 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CgnP59242 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CgnP59242 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CgnP59242 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CgnP59242 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CgnP59242 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CgnP59242 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CgnP59242 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CgnP59242 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CgnP59242 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CgnP59242 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CgnP59242 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CgnP59242 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CgnP59242 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CgnP59242 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CgnP59242 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CgnP59242 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CgnP59242 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CgnP59242 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CgnP59242 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CgnP59242 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CgnP59242 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CgnP59242 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CgnP59242 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CgnP59242 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CgnP59242 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CgnP59242 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CgnP59242 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CgnP59242 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CgnP59242 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CgnP59242 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CgnP59242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CgnP59242 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CgnP59242 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms