Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VegfbP49766 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
VegfbP49766 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VegfbP49766 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VegfbP49766 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VegfbP49766 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
VegfbP49766 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VegfbP49766 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VegfbP49766 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VegfbP49766 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VegfbP49766 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
VegfbP49766 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VegfbP49766 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VegfbP49766 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VegfbP49766 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VegfbP49766 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VegfbP49766 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VegfbP49766 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VegfbP49766 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
VegfbP49766 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VegfbP49766 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VegfbP49766 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VegfbP49766 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VegfbP49766 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VegfbP49766 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VegfbP49766 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VegfbP49766 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VegfbP49766 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VegfbP49766 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30■■■□□ 2.39
VegfbP49766 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VegfbP49766 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30■■■□□ 2.39
VegfbP49766 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VegfbP49766 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VegfbP49766 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VegfbP49766 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VegfbP49766 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VegfbP49766 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VegfbP49766 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VegfbP49766 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VegfbP49766 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VegfbP49766 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VegfbP49766 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VegfbP49766 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VegfbP49766 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VegfbP49766 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VegfbP49766 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VegfbP49766 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VegfbP49766 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VegfbP49766 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VegfbP49766 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VegfbP49766 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VegfbP49766 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VegfbP49766 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
VegfbP49766 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VegfbP49766 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VegfbP49766 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VegfbP49766 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VegfbP49766 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VegfbP49766 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VegfbP49766 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VegfbP49766 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms