Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RetP35546 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RetP35546 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RetP35546 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RetP35546 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RetP35546 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RetP35546 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RetP35546 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RetP35546 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RetP35546 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RetP35546 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RetP35546 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RetP35546 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RetP35546 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RetP35546 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RetP35546 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RetP35546 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RetP35546 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RetP35546 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RetP35546 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RetP35546 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RetP35546 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RetP35546 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RetP35546 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RetP35546 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RetP35546 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RetP35546 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RetP35546 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RetP35546 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RetP35546 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RetP35546 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RetP35546 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RetP35546 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RetP35546 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RetP35546 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RetP35546 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RetP35546 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RetP35546 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RetP35546 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RetP35546 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RetP35546 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RetP35546 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RetP35546 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RetP35546 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RetP35546 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RetP35546 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RetP35546 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RetP35546 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RetP35546 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RetP35546 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RetP35546 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RetP35546 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RetP35546 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RetP35546 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RetP35546 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RetP35546 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RetP35546 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RetP35546 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RetP35546 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RetP35546 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RetP35546 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RetP35546 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RetP35546 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RetP35546 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RetP35546 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RetP35546 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RetP35546 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RetP35546 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RetP35546 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RetP35546 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RetP35546 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RetP35546 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RetP35546 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RetP35546 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RetP35546 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RetP35546 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RetP35546 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RetP35546 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RetP35546 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RetP35546 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RetP35546 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RetP35546 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RetP35546 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RetP35546 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RetP35546 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RetP35546 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RetP35546 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RetP35546 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RetP35546 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RetP35546 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RetP35546 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RetP35546 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RetP35546 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms