Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdh15P33146 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdh15P33146 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdh15P33146 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdh15P33146 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdh15P33146 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdh15P33146 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdh15P33146 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdh15P33146 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdh15P33146 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdh15P33146 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdh15P33146 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Cdh15P33146 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdh15P33146 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdh15P33146 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh15P33146 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh15P33146 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdh15P33146 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdh15P33146 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms