Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Egr1P08046 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Egr1P08046 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Egr1P08046 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Egr1P08046 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Egr1P08046 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Egr1P08046 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Egr1P08046 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Egr1P08046 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Egr1P08046 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Egr1P08046 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Egr1P08046 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Egr1P08046 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Egr1P08046 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Egr1P08046 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Egr1P08046 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Egr1P08046 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Egr1P08046 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Egr1P08046 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Egr1P08046 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Egr1P08046 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Egr1P08046 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Egr1P08046 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Egr1P08046 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Egr1P08046 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Egr1P08046 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Egr1P08046 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Egr1P08046 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Egr1P08046 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Egr1P08046 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Egr1P08046 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Egr1P08046 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Egr1P08046 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Egr1P08046 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Egr1P08046 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Egr1P08046 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Egr1P08046 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Egr1P08046 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Egr1P08046 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Egr1P08046 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Egr1P08046 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Egr1P08046 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Egr1P08046 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Egr1P08046 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms