Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nr1i2O54915 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nr1i2O54915 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nr1i2O54915 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nr1i2O54915 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nr1i2O54915 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nr1i2O54915 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nr1i2O54915 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nr1i2O54915 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nr1i2O54915 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nr1i2O54915 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nr1i2O54915 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nr1i2O54915 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nr1i2O54915 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nr1i2O54915 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nr1i2O54915 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nr1i2O54915 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nr1i2O54915 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nr1i2O54915 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nr1i2O54915 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nr1i2O54915 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nr1i2O54915 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nr1i2O54915 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nr1i2O54915 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nr1i2O54915 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nr1i2O54915 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms