Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csnk2a2O54833 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csnk2a2O54833 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csnk2a2O54833 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Csnk2a2O54833 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Csnk2a2O54833 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Csnk2a2O54833 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Csnk2a2O54833 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Csnk2a2O54833 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Csnk2a2O54833 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Csnk2a2O54833 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csnk2a2O54833 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csnk2a2O54833 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms