Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dgcr6O35347 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dgcr6O35347 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dgcr6O35347 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr6O35347 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr6O35347 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dgcr6O35347 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dgcr6O35347 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dgcr6O35347 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dgcr6O35347 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dgcr6O35347 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dgcr6O35347 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dgcr6O35347 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dgcr6O35347 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dgcr6O35347 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms