Protein–RNA interactions for Protein: J3QJZ1

Gm21969, Predicted gene 21969, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21969J3QJZ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm21969J3QJZ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm21969J3QJZ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm21969J3QJZ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gm21969J3QJZ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm21969J3QJZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm21969J3QJZ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm21969J3QJZ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm21969J3QJZ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm21969J3QJZ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm21969J3QJZ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm21969J3QJZ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gm21969J3QJZ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm21969J3QJZ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm21969J3QJZ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm21969J3QJZ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms