Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcdh11xF6ZNL5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcdh11xF6ZNL5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdh11xF6ZNL5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdh11xF6ZNL5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdh11xF6ZNL5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pcdh11xF6ZNL5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdh11xF6ZNL5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdh11xF6ZNL5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcdh11xF6ZNL5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcdh11xF6ZNL5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcdh11xF6ZNL5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pcdh11xF6ZNL5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcdh11xF6ZNL5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms