Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DspE9Q557 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DspE9Q557 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DspE9Q557 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DspE9Q557 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DspE9Q557 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DspE9Q557 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DspE9Q557 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DspE9Q557 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DspE9Q557 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DspE9Q557 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DspE9Q557 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DspE9Q557 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DspE9Q557 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DspE9Q557 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DspE9Q557 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DspE9Q557 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DspE9Q557 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DspE9Q557 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DspE9Q557 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DspE9Q557 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DspE9Q557 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DspE9Q557 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DspE9Q557 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DspE9Q557 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DspE9Q557 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DspE9Q557 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DspE9Q557 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DspE9Q557 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DspE9Q557 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DspE9Q557 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DspE9Q557 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DspE9Q557 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DspE9Q557 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DspE9Q557 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DspE9Q557 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms