Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm2237E9Q501 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm2237E9Q501 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm2237E9Q501 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm2237E9Q501 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm2237E9Q501 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm2237E9Q501 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm2237E9Q501 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm2237E9Q501 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm2237E9Q501 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm2237E9Q501 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm2237E9Q501 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm2237E9Q501 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm2237E9Q501 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm2237E9Q501 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm2237E9Q501 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm2237E9Q501 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm2237E9Q501 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms