Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsph10bE9PYQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsph10bE9PYQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsph10bE9PYQ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsph10bE9PYQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsph10bE9PYQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsph10bE9PYQ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsph10bE9PYQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsph10bE9PYQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph10bE9PYQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph10bE9PYQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph10bE9PYQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph10bE9PYQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph10bE9PYQ0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph10bE9PYQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph10bE9PYQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph10bE9PYQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rsph10bE9PYQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rsph10bE9PYQ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.7 ms