Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm11569B1AQB1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm11569B1AQB1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm11569B1AQB1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm11569B1AQB1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm11569B1AQB1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm11569B1AQB1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm11569B1AQB1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm11569B1AQB1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm11569B1AQB1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm11569B1AQB1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms