Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MtrA6H5Y3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MtrA6H5Y3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MtrA6H5Y3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MtrA6H5Y3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MtrA6H5Y3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MtrA6H5Y3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MtrA6H5Y3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MtrA6H5Y3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MtrA6H5Y3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MtrA6H5Y3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MtrA6H5Y3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MtrA6H5Y3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MtrA6H5Y3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MtrA6H5Y3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MtrA6H5Y3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MtrA6H5Y3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MtrA6H5Y3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MtrA6H5Y3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MtrA6H5Y3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MtrA6H5Y3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MtrA6H5Y3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MtrA6H5Y3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MtrA6H5Y3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.8 ms