Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Fbxl16A2RT62 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fbxl16A2RT62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fbxl16A2RT62 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Fbxl16A2RT62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fbxl16A2RT62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fbxl16A2RT62 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fbxl16A2RT62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fbxl16A2RT62 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fbxl16A2RT62 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Fbxl16A2RT62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fbxl16A2RT62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fbxl16A2RT62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fbxl16A2RT62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fbxl16A2RT62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fbxl16A2RT62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxl16A2RT62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Fbxl16A2RT62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fbxl16A2RT62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fbxl16A2RT62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fbxl16A2RT62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxl16A2RT62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms