Protein–RNA interactions for Protein: A2CG49

Kalrn, Kalirin, mousemouse

Predictions only

Length 2,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KalrnA2CG49 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KalrnA2CG49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KalrnA2CG49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KalrnA2CG49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KalrnA2CG49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KalrnA2CG49 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KalrnA2CG49 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KalrnA2CG49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KalrnA2CG49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KalrnA2CG49 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KalrnA2CG49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KalrnA2CG49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KalrnA2CG49 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KalrnA2CG49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KalrnA2CG49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KalrnA2CG49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KalrnA2CG49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KalrnA2CG49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KalrnA2CG49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KalrnA2CG49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KalrnA2CG49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms