Protein–RNA interactions for Protein: A2AV72

Mup6, MCG140531, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mup6A2AV72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mup6A2AV72 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mup6A2AV72 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mup6A2AV72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mup6A2AV72 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mup6A2AV72 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mup6A2AV72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mup6A2AV72 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mup6A2AV72 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mup6A2AV72 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mup6A2AV72 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mup6A2AV72 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mup6A2AV72 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mup6A2AV72 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mup6A2AV72 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mup6A2AV72 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mup6A2AV72 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mup6A2AV72 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mup6A2AV72 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mup6A2AV72 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mup6A2AV72 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms