Protein–RNA interactions for Protein: A2AJT4

Pnisr, Arginine/serine-rich protein PNISR, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnisrA2AJT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PnisrA2AJT4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PnisrA2AJT4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PnisrA2AJT4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PnisrA2AJT4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PnisrA2AJT4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PnisrA2AJT4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PnisrA2AJT4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PnisrA2AJT4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PnisrA2AJT4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PnisrA2AJT4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PnisrA2AJT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PnisrA2AJT4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PnisrA2AJT4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PnisrA2AJT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PnisrA2AJT4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PnisrA2AJT4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PnisrA2AJT4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PnisrA2AJT4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PnisrA2AJT4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PnisrA2AJT4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PnisrA2AJT4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PnisrA2AJT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PnisrA2AJT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PnisrA2AJT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PnisrA2AJT4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PnisrA2AJT4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PnisrA2AJT4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PnisrA2AJT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PnisrA2AJT4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PnisrA2AJT4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PnisrA2AJT4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PnisrA2AJT4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PnisrA2AJT4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PnisrA2AJT4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PnisrA2AJT4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms