Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sntg1Q925E1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sntg1Q925E1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms