Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Col5a3Q9JLI2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Col5a3Q9JLI2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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