Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pja2Q80U04 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pja2Q80U04 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms