Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm6Q3UZD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm6Q3UZD5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Prdm6Q3UZD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Prdm6Q3UZD5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Prdm6Q3UZD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prdm6Q3UZD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms