Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 SPG4YMR107W 348 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 CUE5YOR042W 1236 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 ISU2YOR226C 471 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YOR318CYOR318C 306 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RPL21BYPL079W 483 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 CBP3YPL215W 1008 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YOR1YGR281W 4434 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MMP1YLL061W 1752 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GLT1YDL171C 6438 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MFB1YDR219C 1398 nt5.42□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 PUS1YPL212C 1635 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 CTS1YLR286C 1689 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GIP1YBR045C 1920 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RAD18YCR066W 1464 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 TCM62YBR044C 1719 nt5.41□□□□□ -1.54 RIP-Chip
PUF3Q07807 NKP1YDR383C 717 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 ISC10YER180C 804 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YGR045CYGR045C 363 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 TWF1YGR080W 999 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 BET1YIL004C 429 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YNK1YKL067W 462 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YLR400WYLR400W 474 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 TMA16YOR252W 537 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YOR314WYOR314W 330 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RRN7YJL025W 1545 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GCR2YNL199C 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 BSC1YDL037C 987 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 GRX3YDR098C 858 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 NAG1YGR031C-A 492 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YJL193WYJL193W 1209 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 UTP30YKR060W 825 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 NMA1YLR328W 1206 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 MAP2YBL091C 1266 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 YPL185WYPL185W 396 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 RPB5YBR154C 648 nt5.4□□□□□ -1.54
PUF3Q07807 CLA4YNL298W 2529 nt5.4□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 HOF1YMR032W 2010 nt5.4□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 AEP2YMR282C 1743 nt5.4□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PUF3Q07807 RGT1YKL038W 3513 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YGR182CYGR182C 354 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 PEX21YGR239C 867 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 PET130YJL023C 1044 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RPS1AYLR441C 768 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RHO5YNL180C 996 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ATX2YOR079C 942 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ZUO1YGR285C 1302 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 SDA1YGR245C 2304 nt5.39□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 PMA1YGL008C 2757 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 MCX1YBR227C 1563 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 BIT2YBR270C 1638 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YCR022CYCR022C 345 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RPS16BYDL083C 432 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RSM18YER050C 417 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YGR018CYGR018C 330 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 VPH2YKL119C 648 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 CAM1YPL048W 1248 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 NIP7YPL211W 546 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ARN2YHL047C 1863 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YNL095CYNL095C 1929 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 PHO5YBR093C 1404 nt5.38□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 MIC60YKR016W 1623 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 KNH1YDL049C 807 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 HMO1YDR174W 741 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 MLC1YGL106W 450 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 MND1YGL183C 660 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 THG1YGR024C 714 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 FMP33YJL161W 543 nt5.37□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PUF3Q07807 GIM3YNL153C 390 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 CAF20YOR276W 486 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ATG5YPL149W 885 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 EMP47YFL048C 1338 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ALG2YGL065C 1512 nt5.37□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 TSC13YDL015C 933 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 HLR1YDR528W 1272 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 DSE2YHR143W 978 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 THP2YHR167W 786 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YKL083WYKL083W 615 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ENV10YLR065C 546 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 PPT2YPL148C 522 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 MAK3YPR051W 531 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 THI21YPL258C 1656 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 ARB1YER036C 1833 nt5.36□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 CYK3YDL117W 2658 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 UBP9YER098W 2265 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 TEA1YOR337W 2280 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 IMA3YIL172C 1770 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 IMA4YJL221C 1770 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 CUE2YKL090W 1332 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RTT102YGR275W 474 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YHR213WYHR213W 597 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YKL063CYKL063C 504 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RPC37YKR025W 849 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YAR062WYAR062W 597 nt5.35□□□□□ -1.55 RIP-Chip
PUF3Q07807 GIM5YML094W 492 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 TPP1YMR156C 717 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 SCW10YMR305C 1170 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 RFC5YBR087W 1065 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 YBR096WYBR096W 693 nt5.35□□□□□ -1.55
PUF3Q07807 UBA1YKL210W 3075 nt5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.4 ms