Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme1P97371 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Psme1P97371 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Psme1P97371 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Psme1P97371 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Psme1P97371 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms