Protein–RNA interactions for Protein: P60670

Nploc4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nploc4P60670 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nploc4P60670 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nploc4P60670 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms